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Utilisation et applications de la bio-informatique

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Description

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    Formation

Missions, moyens et organisation
Le Cnam est placé sous la présidence de Jean-Paul Herteman, P-DG du groupe Safran, et dirigé par Olivier Faron.
Il remplit trois missions principales:
la formation professionnelle supérieure tout au long de la vie,
la recherche technologique et l'innovation,
la diffusion de la culture scientifique et technique.
Le Cnam offre des formations développées en étroite collaboration avec les entreprises et les organisations professionnelles afin de répondre au mieux à leurs besoins et à ceux de leurs salariés. Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants : Entrée
CC65p-1 Certificat de compétence Bio-informatique
Centres d'enseignement Entrée
CC87p-1 Certificat de compétence Bioanalyse
Centres d'enseignement Entrée
CYC74p-1 Ingénieur diplômé de l'école d'ingénieurs du Cnam Spécialité bio-informatique
Centres d'enseignement Entrée
CYC75p-1 Ingénieur diplômé de l'école d'ingénieurs du Cnam Spécialité génie biologique
Centres d'enseignement Entrée
LG025p1 Licence Sciences, technologies, santé, parcours mention informatique générale
Centres d'enseignement Entrée
LG034p10 Licence Sciences technologies santé mention sciences pour l'ingénieur , parcours Génie biologique
Centres d'enseignement Entrée
LP014p-1 Licence professionnelle Biotechnologie, parcours Bio-informatique pour les biotechnologies
Centres d'enseignement Public et conditions d'accès Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2).
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent. Dans ce cas, une connaissance préliminaire de la biologie/biochimie est recommandée, par exemple grâce à l'UE Biochimie Fondamentale #BCA001.

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Les Avis

Les matières

  • Ingénieur du son
  • Biochimie
  • Biotechnologie
  • Génie biologique
  • Protéines

Le programme

Contenu 1) Rappels de base de biologie à usage pour la bio-informatique :
Les chaînes du vivant, ADN et Protéines.
La cellule : unité fonctionnelle du vivant.
Éléments de physiopathologie : inflammation, maladies infectieuses et cancers
2) Les grandes banques bio-informatiques :
Banques de données disponibles sur Internet :
séquences, polymorphismes, structure des protéines. Le système Entrez : du gène à la fonction.
3) Exploitation des banques de séquences et applications :
Les logiciels disponibles sur Internet :
criblage de banque, alignement de deux séquences, phylogénie. Principes algorithmiques et utilisation.
4) Modélisation moléculaire et applications :
Logiciels de référence (RasMol, Cn3D, VMD). Prédiction de structure, méthodes automatiques.
5) Problématiques Bio-informatiques liées aux nouvelles technologies :
Séquençage du génome  (Next Generation Sequencing, NGS), puces de génotypage, puces de transcriptome, génomique sur cohorte et maladies, systèmes double-hybrides, gels bi-dimensionnels, systèmes protéines pull-downs, spectrométrie de masse
Modalités de l'évaluation Examen final
Bibliographie
  • AD Baxevanis et al. : Bioinformatics, Wiley Interscience. New-York
  • Denis Tagu et Jean-Loup Risler : Bio-informatique. Principes d'utilisation des outils. Edition Quae

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