Spécialité bim - bioinformatique et modélisation (m2)

La spécialité BIM couvre des problématiques trés pratiques et actuelles, comme la génomique et la fouille de grande quantités de données biologiques, ce qui assure des debouchés professionnels de cette spécialité. Elle aborde aussi des domaines plus prospectifs faisant l'objet de recherches de pointe dans nos laboratoires. On vise à ce que nos étudiants fassent une thèse dans des nombreux centres hors université : INRIA, Genoscope-CEA, INRA, etc. D'autres étudiants iront vers des labos (biologie, écologie, biomécanique, médecine...) universitaires. Le nouveau laboratoire de "génomique des microorganismes" crée à l'UPMC accueillera des étudiants "ventuellement int"ressés à realiser une thèse expérimentale avec une partie d'analyse "en silico "et des étudiants interessés au d"veloppement de nouvelles méthodologies d'analyse de données "en silico".

La spécialité permet aux étudiants d'informatique d'acquérir des compétences dans le domaine de la bioinformatique et de la modélisation tout en assurant aux étudiants une formation d'informaticiens. Le developpement de leurs connaissances en algorithmique et en intelligence artificielle leur permettront d'apporter des contributions méthodologiques originales dans ce domaine.

Pour garantir des bases solides en informatique, nous proposons une première année (M1) de cours approfondis en informatique partagés avec les spécialités STL et IAD et couvrant les connaissances nécessaires en algorithmique, combinatoire et statistiques. Les étudiants suivront aussi des cours de statistiques et d'introduction aux bases de la biologie, à la bioinformatique et à la modélisation. Ces modules permettront aux étudiants de se familiariser avec la pluridisciplinarité grâce au contenu des enseignements et à travers la collaboration entre étudiants de disciplines différentes au sein du programme international de master BIMM, qui partagera ses cours avec la spécialité.

La seconde année (M2) sera constituée par une partie de cours et un stage. Les cours de M2 seront, pour la plupart, donnés par au moins deux intervenants, dont l'un biologiste. Ceci permettra de s'assurer que les étudiants restent sensibles aux enjeux des problématiques en biologie. Une ample variété de cours de modélisation est d'ores et déjà proposée à l'UPMC. Nous assurerons en septembre 2009 dans cette spécialité environ 10 nouvelles UE dédiées à la bioinformatique et à la modélisation.

La spécialisation partage quelques UE de M1 et un grand nombre d'UE de M2 avec la spécialité "mathématiques de la modélisation" de la mention mathématiques du master de l'UPMC, la mention "biologie moléculaire et cellulaire" et la mention "biologie intégrative et physiologie".