Master mention Sciences du Génome et des Organismes spécialité Biologie Systémique et Synthétique

Module optionnel « Remise à niveau »

Module

Volume horaire

UE0

Remise à niveau

- Introduction à la Biologie génomique

34

- Introduction à l’apprentissage statistique pour l’inférence de réseaux biologiques

- Introduction aux Mathématiques pour la Biologie

17

17

3 Unités d’Enseignement obligatoires

Module

Volume horaire

UE1

Langues vivantes

- Langue vivante 1

- Langue vivante 2

50

UE2

Biologie

Intégrative

- Vue intégrée et spatiale de la machinerie cellulaire : de la biologie vers la modélisation

- Modélisation intégrée en Physiologie

40

UE8

Biologie

synthétique

- Biologie Synthétique pour la Chimie biosynthétique

- Conception, construction et caractérisation de parties et de dispositifs biologiques

- Pratique du génie de dispositifs biologiques

- Modélisation et ingénierie des réseaux d’interactions moléculaires

80

dont

42 h de TP

3 Unités d'Enseignement au choix parmi les 5 suivantes :

Module

Volume horaire

UE3

Intégrations de données et Bio-ingénierie

- Biologie des systèmes et Bio-ingénierie

- Biologie des systèmes expérimentale : production et interprétation des données en «-omique»

- Pratique de modélisation de systèmes complexes : de l’intégration de données aux prédictions/falsifications

40

dont

TP

UE4

Mathématiques pour la Biologie Systémique

- Analyse statistique de séquences biologiques et données d’expression

- Apprentissage statistique pour l’inférence de réseaux biologiques

40

UE5

Modèles et langages de simulation pour la Biologie Systémique

- Approche langage pour la modélisation et la simulation de systèmes biologiques

- Formalismes pour l’ingénierie des systèmes et des réseaux biologiques

40

UE6

Modèles dynamiques discrets de réseaux de régulation biologiques

- Approches symboliques des réseaux de régulation génétique

- Test appliqué aux objets biologiques

40

UE7

Modélisation et design moléculaire

- Matière molle pour la Biologie Synthétique

- Modélisation moléculaire : interactions et ingénierie computationnelle des protéines

40

Le semestre 3 comprend un module optionnel de remise à niveau, trois Unités d'Enseignement (UE) obligatoires et trois UE au choix, pour un total de 30 crédits européens (ECTS). Les Unités optionnelles du Module "Remise à niveau" portent sur la Biologie (pour les étudiants non biologistes), ou l'Informatique et les Mathématiques (pour les biologistes). Ce programme est complété par un cycle de conférences données par des orateurs internationaux. Une liste d'orateurs invités, de laboratoires académiques ou privés, est établie sur proposition des étudiants précédée d'une séance de travail avec quelques enseignants et suivie d'une validation par l'équipe pédagogique.

Le semestre 4 est consacré à des stages de 6 mois en laboratoires situés en France ou à l’étranger, pour un total de 30 crédits européens supplémentaires : 21 crédits de mi-février à juin, avant les examens de fin juin ; et 9 crédits en juillet et août, soit pour continuer les recherches dans le laboratoire de stage, soit pour préparer à Genopole® la compétition iGEM de novembre suivant. La liste des laboratoires d’accueil (USA, Europe et France) peut être consultée sur le site .