Communautés bactériennes marines et pollution microbienne

Objectifs pédagogiques
Présentation des communautés bactériennes des différents compartiments du milieu marin.
Présentation du rôle de ces communautés bactériennes.
Présentation de la potentialité de certaines bactéries marines dans les mécanismes de bio-remédiation.
Présentation des différentes étapes de la mise en place d’un biofilm bactérien.
Présentation du phénomène de biocorrosion.
Présentation des techniques moléculaires utilisées en écologie microbienne.
Présentation de l’utilisation de la spectrométrie de masse pour identifier rapidement des souches bactériennes marines.
Présentation des procédures de suivi de la qualité microbiologique d’un milieu et présentation des espèces bactériennes indicatrices de cette qualité microbiologique.

Compétences visées
- Connaitre les différentes communautés bactériennes marines et leurs rôles.
- Maitriser les outils moléculaires utilisés en écologie microbienne.
- Connaitre les processus et les conditions de mise en place d’un biofilm microbien et les problèmes de biocorrosion engendrés.
- Maitriser les procédures de prélèvement et de conservation des échantillons marins en vue d’analyses microbiologiques.
- Maitriser les bonnes pratiques des analyses microbiologiques et moléculaires.