Outils mathématiques et informatiques pour la génomique
Formation
À Paris Cédex 03
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Description
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Typologie
Formation
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Lieu
Paris cédex 03
-
Dates de début
Dates au choix
Public et conditions d'accès
UEs d'informatique, de statistiques, et BNF104 du diplôme d'ingénieur de bio-informatique
Public de niveau Master
Objectifs pédagogiques
Connaitre les données, les outils algorithmiques et statistiques pour le développement des logiciels de traitements des données génomiques et post-génomiques
Compétences visées
Utilisation des outils mathématiques et informatiques pour le traitement des données génomiques et post-génomiques : nettoyage des données (package dplyr), programmation dynamique, automates, modèles bayésiens, modèles de Markov, utilisation de R.
Mots-clés
Génomique
Biotechnologie
Bioinformatique
Algorithmique
Traitement informatique des données
Les sites et dates disponibles
Lieu
Date de début
Date de début
À propos de cette formation
Utilisation des outils mathématiques et informatiques pour le traitement des données génomiques et post-génomiques : nettoyage des données (package dplyr), programmation dynamique, automates, modèles bayésiens, modèles de Markov, utilisation de R.
Les Avis
Les matières
- R&D
Le programme
Contenu
Présentation des approches pour l'alignement des séquences biologiques et de leurs applications
Présentation des bases de données génomiques
Présentation des méthodes de traitement des données génotypiques (SNP, CNV, indel,haplotypes, imputation,génotype, séquençage) et de leurs applications
Applications réalisées en TP de bioinfo avec notamment R et Bioconductor.
Modalité d'évaluation
Examen final
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