Master Océanographie Spécialité "Biologie et Ecologie Marines"

À Marseille

Prix sur demande

Description

  • Typologie

    Master 1 et 2

  • Lieu

    Marseille

  • Durée

    2 Ans

Description

Objectifs: Présentation du M1 (Master 1 deg; année) et du M2 (Master 2 deg; année) d'Océanographie, spécialité 'Biologie et Ecologie Marines': Unités d'Enseignement (UE) obligatoires et optionnelles, contenu des UEs, responsables des UEs, etc. (mise à jour: Ao ucirc;t 2009) Le stage court (UE 231) est optionnel en M1. Il peut être effectue par anticipation (= de Mai à Ao ucirc;t 2010, donc avant la rentrée), sous réserve d'un accord préalable avec le responsable de la spécialité 'Biologie et Ecologie Marines' (Prof. Charles F. Boudouresque). Ce stage comptant pour 6 ECTS, sa durée indicative est de 3-4 semaines

Installations

Lieu

Date de début

Marseille ((13) Bouches-du-Rhône)
Voir plan
Station Marine d'Endoume - Rue de la Batterie des Lions -13007 Marseille, 13007

Date de début

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Questions / Réponses

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Ramla Bouhlel - 02/10/2019 | Répondre

Le programme

UE 104 BENT ("Structure et fonctionnement des écosystèmes benthiques")

Présentation et plan de l'ensemble du cours (ppt, pdf)

Cours de Jean-Pierre Féral sur le benthos antarctique (Décembre 2005)

Documents correspondant au TD sur publications de Pierre Chevaldonné (2009) :

Consignes générales (concernant l'organisation du TD)

Publication Escobar et al.

Publication Fisher et al.

Publication Freytag et al.

Publication Jarnegren et al.

Publication Jenkins et al.

Publication Rouse et al.

Documents correspondant au TD de Christophe Lejeusne "Fluctuations des écosystèmes à macrophytes" (2006) :

Consignes générales concernant l'organisation du TD

Publication Frederiksen et al 2004

Publication Macia 2000

Publication Tegner et al 1996

Publication Tomasko et al 2005

Publication Ruiz et Romero 2003

Publication Ruiz et al 2001

Restitution du TD substrats meubles : Christophe Lejeusne (Novembre 2006) (pdf)

TP otolithométrie : Fabien Morat (2009)

Introduction à la sortie en mer "fonds meubles littoraux" : Cedric Javanaud (2009)

Introduction à l'usage des isotopes stables : voies métaboliques et réseaux trophiques : Cédric Javanaud (2009)

Voir également à la rubrique "Documents correspondant aux enseignements de Charles F. Boudouresque" (retourner à l'index)

UE 106 DOM ("Diversité des organismes marins") et UE 359 DOMA ("Diversité des organismes marins : notions avancées")

Plan du cours (ppt, pdf)

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 1.

L'arbre du vivant (ppt, pdf)

Introduction. L'arbre du vivant. Mais où sont donc passés les végétaux, algues, champignons, protozoaires ? L'origine de la Vie. Procaryotes et Eucaryotes.

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 2.

Origine, évolution et biocycle des Eucaryotes (ppt, pdf)

L'origine des Eucaryotes et les endosymbioses primaires, secondaires et tertiaires. Kleptoplastie et karyopleptie : endosymbioses en cours ? L'évolution des Eucaryotes. Les "big bangs" biologiques. Le biocycle (cycle biologique).

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 3.

Les Alvéolés (ppt, pdf)

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 4.

Les Straménopiles, Haptobiontes, Cryptobiontes et taxons apparentés récemment découverts (ppt, pdf)

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 5.

Les Plantae (Centrohelida, Rhodobiontes, Viridiplantae) (ppt, pdf)

Cours Charles F. Boudouresque (2009). Diversité des organismes marins. 6.

Les Opisthochontes (Fungi et Microsporidies) (ppt, pdf)

Cours de Valérie Michotey sur les Procaryotes (ppt, pdf)

Cours N°1 (2009)

Cours de Emmanuelle Reanard-Deniel (ppt, pdf)

Cours N°1 (2009) Eucaryotes unicellulaires et origine de la pluricellularité

Cours N°2 (2009) Les métazoaires basaux

Cours N°3 (2009) Bilatériens

Cours N°4 (2009) Bilatériens

Cours N°5 (2009) Conclusions Holozoaires

Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2006-2007)

Les exposés ppt des étudiants sont accessibles après la référence de la publication correspondante (cliquer sur "exposé")

Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2007-2008)

Les exposés ppt des étudiants sont accessibles après la référence de la publication correspondante (cliquer sur "exposé")

Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2008-2009)

Les exposés ppt des étudiants sont accessibles après la référence de la publication correspondante (cliquer sur "exposé")

Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2009-2010)

Corrigé exercice TD Carole Borchiellini (2006)

Lectures recommandées :

Claverie J.M., 2006. Viruses take center stage in cellular evolution. Genome Biology, 7 (110) : 1-5.

Gazave E. et al., 2008. NK homeobox genes with choanocyte-specific expression in homoscleromorph sponges. Dev. Genes Evol., 218 : 479-489.

Suttle C.A., 2007. Marine viruses - major players in the global ecosystem. Nature Reviews Microbiology, 5 (10) : 801-812.

UE 227 FLUC ("Fluctuations et perturbations, naturelles et anthropiques, des écosystèmes marins")

Présentation et plan de l'ensemble du cours (ppt, pdf)

Lectures recommandées :

Morri C., Bianchi C.N., 2001. Recent changes in biodiversity in the Ligurian Sea (NW Mediterranean): is there a climatic forcing? In: Mediterranean ecosystems: structures and processes, Faranda F.M., Guglielmo L., Spezie G. (eds.), Springer Verlag Italia publ. : 375-384.

Vasseur D.A., Fox J.W., 2007. Environmental fluctuations can stabilize food web dynamics by increasing synchrony. Ecology Letters, 10 : 1066-1074.

Publication de Massé H, 2000. Long-term changes in sand bottom macrofauna along the coast of Provence (Northwestern Mediterranean Sea). Oceanologica Acta, 23 (2) : 229-242 (pdf).

Conversi A., Peluso T., Fonda-Umani S., 2009. Gulf of Trieste : A changing ecosystem. J. Geophysical Res., 114 (C03S90) : 1-10.

Cours de Charles F. Boudouresque :

Partie 1 : Les fluctuations naturelles (2010) (ppt, pdf)

Partie 2 : Les forçages climatiques (2010) (ppt, pdf)

Partie 3 : La théorie des perturbations (2010) (ppt)

Partie 4 : Perturbations naturelles. Rôle des perturbations (2010) (ppt, pdf).

Partie 4 (2010) (version ppt non enregistrée en pdf)

Partie 5 : Mécanismes de réaction et correction des perturbations et stress (2010) (ppt, pdf)

Partie 5 (2010) (version ppt non enregistrée en pdf)

Partie 6 : Grands types de perturbations et de stress liés à l'Homme (2009) (ppt, pdf)

Partie 7 : Les perturbations dans quelques grands types d'écosystèmes (2009) (ppt, pdf)

Cours de Thierry Perez (2010) : "Impact des changements climatiques sur la biodiversité en mer Méditerranée"

Changement climatique biodiversité (ppt, pdf)

Cours de Thierry Perez (2010) : Conséquences biologiques du réchauffement global"

Réchauffement global (ppt, pdf

Cours de Daniela Banaru et Thierry Perez (2009) : "Changement global et vulnérabilité des écosystèmes marins côtiers ; le cas de la Méerranée".

Réchauffement climatique (ppt, pdf)
Cours de Daniela Banaru (2009) : "Conséquences biologiques du réchauffement global"

Conséquences biologiques réchauffement (ppt, pdf
Cours TD de Daniela Banaru (2009) :
Pollution marine (ppt, pdf)
Pêche en mer noire (ppt, pdf
Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2006-2007)
Les exposés ppt des étudiants sont accessibles, à la suite de la copie de la publication (cliquer d'abord ci-dessus).
Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2007-2008)
Les exposés ppt des étudiants sont accessibles, à la suite de la copie de la publication (cliquer d'abord ci-dessus).Liste et copies pdf des publications proposées pour les exposés sur publications (année 2009-2009)

Les exposés ppt des étudiants sont accessibles, à la suite de la copie de la publication (cliquer d'abord ci-dessus).
Liste et copies pdf des publications proposées pour les exposés sur publications (année 2009-2010)
UE 228 ECON ("Initiation à l'économie de l'environnement")
Documents correspondant aux cours de 2007-2008.

Plan du cours de Hubert Stahn (pdf)

Plan du cours de Agnès Tomini (pdf)

Plan du cours de Stéphanie Le Maître (pdf)

Correction d'un exercice de Agnès Tomini sur l'évaluation contingente

Cours de Agnès Tomini : chapitre 1 (fondements théoriques de l'évaluation environnementale)

Cours de Agnès Tomini : chapitre 2 (méthodes d'évaluation de l'environnement)

Cours de Agnès Tomini : chapitre 3 (défaillances de marchés, biens publics, externalités)

Cours de Agnès Tomini :exercices sur le chapitre 3
Cours de Agnès Tomini : chapitre 4 (la régulation environnementale)
Cours de Stéphanie Le Maître : chapitre 7 (l'internalisation des effets externes)
Cours de Stéphanie Le Maître : chapitre 9 (le changement climatique et le protocole de Kyoto)
Documents correspondant aux cours de 2008-2009.
Exercice N°1 (Camila Niño Fernández)
UE 357 ("Invasions et transferts biologiques")
Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2006-2007)
Les exposés ppt des étudiants sont accessibles après la référenc de la publication correspondante (cliquer sur "exposé")
Liste et copies pdf des publications proposées pour les "exposés sur publications" (année 2007-2008)
Les exposés ppt des étudiants sont accessibles après la référence de la publication correspondante (cliquer sur "exposé")
Publications dont la lecture est recommandée en complément au cours :
BARDSLEY D., EDWARDS-JONES G., 2006. Stakeholder's perceptions of the impacts of invasive exotic plant species in the Mediterranean region. GeoJournal, 65 : 199-210.
BRIAND F. (ed.), 2007. Impact of mariculture on coastal ecosystems. CIESM workshop monographs, 32. Nombreuses communications.
CARLTON J.T., GELLER J.B., 1993. Ecological roulette : the global transport of nonindigenous marine organisms. Science, 261 : 78-82.
LAFFERTY, 2006. Can the common brain parasite, Toxoplasma gondii, influence human culture. Proc. royal Soc. B, 273 : 2749-2755.
MACK R.N., LONSDALE W.M., 2002. Eradicating invasive plants: hard-won lessons for islands. In: Turning the tide: the eradication of invasive species. Veitch C.R., Clout M.N. (eds.), IUCN SSC Invasive Species Specialist Group, IUCN publ., Gland, Switzerland and Cambridge, UK : 164-172.
VILA M., TESSIER M., GOMENO I., MORAGUES E., TRAVESET A., de la BANDERA M.C., SUEHS C.M., MEDAIL F., AFFRE L., GALANIDIS A., DALIAS P., PETSIKOS B., CARTA L., MANCA M., BRUNDU G., 2004. Impacts of plant invasion on species diversity in Mediterranean islands. Proc. 10th MEDECOS conference, Rhodes, Greece, Arianoutsou et Papanastasis (eds.), Millpress publ., Rotterdam : 1-7.
WOLFE N.D., PANOSIAN DUNAVAN C., DIAMOND J., 2007. Origins of major human infectious diseases. Nature, 447:279-283.
Les espèces introduites et invasives en milieu marin. Troisième édition. 2008 (pdf).
Cet ouvrage correspond au cours de Charles F. Boudouresque. Effectivement publié (GIS Posidonie Publisher) et doté d'un numéro d'ISBN, il peut donc être cité (citation recommandée, voir page 2)
Cours Charles F. Boudouresque (power-point) :
Cours N°1 (introduction, définitions et critères de reconnaissance) (année 2009)
Cours N°2 (vecteurs, causes et processus d'introduction. Nombre d'espèces introduites) (année 2009)
Cours N°3 (conséquences écologiques) (année 2009)
Cours N°4 (conséquences économiques) (année 2008
Cours N°5 (prévention, contrôle, éradication, conclusions) (année 2008)
Cours Prof. Antoni Penaud :
Angiostrongylus cantonensis (pdf)
Echinococcus multilocularis (pdf)
Entamoeba histolytica (amibiase) (pdf)
Enterobius vermicularis (oxyuriose) (pdf)
Fasciola hepatica (pdf)
Onchocerca volvulus (pdf)
Schistosoma haemalobium (pdf)
Strongyloides stercoralis (anguillulose) (pdf)
Taenia saginata (pdf)
Taenia solium (pdf)
Tiphus Rickettsia prowazeki (pdf)
Virus EEE et amaril (pdf)
Wuchereria bancrofti (filariose elephantiasis) (pdf)
Yersinia pestis (pdf
Travaux Dirigés :
Marc Verlaque : étude de cas : Caulerpa racemosa (ppt)
UE 358 AERME 1 et UE 377 AERME 2 ("approche écosystémique des Ressources Marines Exploitées") (anciennement : UE 60)

Cette UE du Master 2 d'Océanographie (spécialité "Biologie et Ecologie Marines") est mutualisée avec les Universités de Montpellier, Paris 6 et Rennes. Les enseignements se déroulent au centre IRD-IFREMER de Sète
Présentation de l'UE 60 (ppt
Plan du cours AERME année 2008-2009
UE 363 "Protection, restauration et gestion durable en milieu marin 1"
Cette UE du Master d'Océanographie est commune à la spécialité recherche "Biologie et écologie marines" et à la spécialité pro "Environnement marin".
Cours Charles F. Boudouresque
Cours Charles F. Boudouresque N°1 (2009-2010) : Introduction, développement durable, biodiversité, protection des espèces.
Cours Charles F. Boudouresque N°2 (2009-2010) : Aires Marines Protégées.
Cours Charles F. Boudouresque N°3 (2009-2010) : Restauration.
Cours Denise Bellan-Santini
Cours Bellan-Santini N°1 (2009-2010) : Droit de l'environnement marin.
Cours Bellan-Santini N°2 (2009-2010) : Inventaires ZNIEFF en région PACA.
Cours Bellan-Santini N°3 (2009-2010) : Directives et conventions européennes.
Cours Bellan-Santini N°4 (2009-2010) : Directive européenne "Stratégie en milieu marin".
Cours Bellan-Santini N°5 (2009-2010) : Gestion intégrée des zones côtières (GIZC).
Cours Bellan-Santini N°6 (2009-2010) : Grenelle de la mer.
Cours Bellan-Santini N°7 (2009-2010) : Espaces protégés, parcs et réserves.
Cours Bellan-Santini N°8 (2009-2010) : Plan Bleu, perspectives à 2025.
Cours Bellan-Santini N°9 (2009-2010) : Natura 2000.
Cours Thierry Perez
Cours Thierry Perez (2009-2010) : Bioindicateurs.
Publications recommandées
COSTANZA R., D'ARGE R., DE GROOT R., FARBER S., GRASSO M., HANNON B., LIMBURG K., NAEEM S., O'NEILL R.V., PARUELO J., RASKIN R.G., SUTTON P., VAN DER BELT M., 1997. The value of the world's ecosystem services and natural capital. Nature, 387 : 253-260.
SOLAN et al., 2004. Extinction and ecosystem function in the marine benthos. Science, 306 : 1177-1180.
UE 364 "Protection, restauration et gestion durable en milieu marin 2"
Cours Benjamin Genovesi
Cours Benjamin Genovesi N°1 (2009-2010) : Les efflorescences toxiques.

Master Océanographie Spécialité "Biologie et Ecologie Marines"

Prix sur demande