ALGORITHMIQUE DE LA BIO-INFORMATIQUE - BNF103

- Début de la formation : 012015 Calendrier de la formation Se renseigner auprès de l'établissement Exigences préalables information non communiquée Objectifs Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bioinformatique. Modalités de contrôle Attestation La fiche détaillée du partenaire Public concerné et conditions d'accès Pré requis : Les auditeurs devront de préférence avoir assisté au cours BNF102 ou sinon justifier d'un niveau suffisant en programmation Biologistes ou Informaticiens. Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2) Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent. Finalités de l'unité d'enseignement Objectifs pédagogiques : Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bioinformatique. Capacités et compétences visées : Cette formation doit permettre aux auditeurs non initiés de comprendre le fonctionnement des principaux programmes de la bio-informatique et pour pouvoir les utiliser au mieux. Organisation Nombre de crédits enseignements ECTS 6 ECTS Modalités de validation : Examen final Contenu de la formation 1) Bases algorithmiques 2) Alignements multiples et recherche de motifs 3) Recherche de similarités dans les banques : BLAST et FASTA 4) Assemblage de séquences et présentation de logiciels 5) Automates et expressions régulières 6) Recherche de gènes : méthodes heuristiques Bibliographie Auteurs Titre AD Baxevanis et al. Wiley Interscience New York (USA) Bioinformatics L. Bloch Ed Technip Initiation à la programmation avec Scheme