Traçabilité des bactéries : Réalisation d’empreintes génétiques par électrophorèse en champ pulsé (Pulsotypage)

- Rappels Théoriques
• Intérêt de la méthode
• L’équipement, les réactifs, les méthodes
• Le Contrôle de Qualité

- Visite du laboratoire

- Réalisation d’une empreinte en laboratoire (Pratique)
• Mise en culture des bactéries
• Préparation de la bactérie
• Préparation des inserts (lyse, déprotéinisation, rinçage)
• Mise en restriction d’inserts
• Préparation de l’électrophorèse
• Arrêt des restrictions
• Programmation et démarrage de l’électrophorèse
• Photographie du gel d’électrophorèse

- Analyse bioinformatique des empreintes
Traitement des empreintes, gestion de la base de données
• Du gel à l’empreinte
• Normalisation
• Exploitation des contrôles de qualité
• Comparaison des empreintes
- les coefficients
- le dendrogramme

- Questionnaire d’évaluation de la formation

- Discussion / Questions